В свое время это человек задумал нечто неслыханное: решил в условиях коммунистической диктатуры заняться политикой вне существующих структур. «Маркус Меккель попросил разузнать, какие нужны предпосылки для того, чтобы основать партию»,- писал в своем рапорте в службу госбезопасности внештатный агент по кличке «Ральф Ширмер». «Меккель вполне серьезно собирается,- сообщал он,- основать собственную партию». Человеком, написавшим рапорт, был, как позднее выяснилось, никто иной, как Вольфганг Шнур, - «заботливый» адвокат, консультировавший в свое время многих восточногерманских диссидентов. Меккель с юности хотел заниматься политикой. В год 20-летия ГДР за нежелание приспосабливаться его исключили из школы. Аттестат о среднем образовании он получил в церковной школе, после чего поступил в университет на факультет теологии. Став священником, он остался верен оппозиции, в первую очередь, движению в защиту мира. Некоторые из его церковных начальников его глубоко протестанские по своему духу инициативы оценивали с известной долей цинизма. Земельный суперинтендант критически замечал: «Другие пасторы разводят пчел, Меккель занимается политикой».

Но Маркус Меккель не ограничивался оппозиционными кружками регионального значения, он еще в начале 80-х думал о создании общенационального движения. Написав вместе с Мартином Гутцайтом и другими призыв к созданию социал-демократической партии и претворив его в жизнь непосредственно в 40-вую годовщину со дня основания ГДР, он поднял провоцирование властей на новый уровень. Делая это, он осознавал, какие могут быть последствия. «О том, что «Штази» захочет применить ко мне меры физического воздействия, я не думал. Боялся я прежде всего за семью. Службы госбезопасности пытались шантажировать меня, намекая на возможные негативные последствия для моей семьи. Я из-за этого очень переживал». Однако к осени 1989 хоннекеровская система уже настолько прогнила, что оказалась не в состоянии сопротивляться активным действиям правозащитников и массовым демонстрациям. Меккель получил, наконец, возможность заняться большой политикой.

В апреле 1990 г. он стал одним из представителей социал-демократической партии в единственном демократически избранном правительстве ГДР, заняв пост министра иностранных дел. Вступая в должность, он поставил себе максимально высокую планку: будучи убежденным сторонником мира, акцент в своей работе он хотел сделать на правах человека и пацифизме. Но в 1990 г. в предчувствии стремительно приближающегося объединения Германии у такого подхода было мало шансов на победу. Востребован был политический прагматизм. Для многих участников переговоров по схеме «два плюс четыре» морализм Маркуса Меккель был помехой. Непосредственно же в том факте, что он в итоге так и не поставил свою подпись под договором об объединении Германии, виноват внутриполитический спор, приведший к выходу СДПГ из большой коалиции.

Меккель проработал до 2009 г. депутатом Бундестага от СДПГ. И здесь он тоже не изменил своим убеждениям, занимаясь разработкой политики в области безопасности, основанной на моральных принципах. За эту деятельность, а также за активное участие в критическом изучении восточногерманской истории в качестве председателя наблюдательного совета Фонда исследований диктатуры СЕПГ, Маркус Меккель был удостоен ряда немецких и международных наград.