Как утверждает сам Зайдель, по натуре он не борец, но не обращать внимание людей на вопиющие противоречия, тем не менее, он не может. Отцу Эберхарда принадлежала небольшая фабрика, которую потом национализировали. Несмотря на свое буржуазное происхождение, делавшее его изгоем в государстве рабочих и крестьян, Эберхард Зайдель не испытал серьезных проблем в школе и смог получить аттестат зрелости. В ГДР молодого человека смущали прежде всего «противоречия между теорией и практикой».

Учась на медицинском факультете в Берлине, он вступил в студенческую евангелическую общину, где познакомился со своей будущей женой Юттой. Ему были по душе проникнутые свободомыслием и творческим духом дискуссии о политике и обществе, инициатором которых выступал студенческий пастор. В эти годы у Эберхарда Зайделя созрело желание заняться пацифистской деятельностью под эгидой церкви. 

Став врачом, Эберхард Зайдель намеревался вступить в комитет «Врачи ГДР за предотвращение ядерной войны», но его не приняли. «Это не то общество, в которое может вступить каждый», - сказали ему. А еще, никто из официальных лиц не желал слушать разговоры о том, что угроза ядерной войны исходит не только от Запада. Эти противоречия подвигли Эберхарда Зайделя на то, чтобы основать вместе с женой и несколькими коллегами под эгидой церкви секцию «Врачи за мир» - своеобразную альтернативу уже существовавшей лояльной государству организации. Критически настроенных врачей волновали такие темы, как ядерное разоружение на Востоке и на Западе, социальная справедливость, свобода слова и права человека. Выступать в школах с беседами о разрушении образа врага или воспитании в духе мирного сосуществования им также не разрешили. 

«Я не собирался подрывать государственные устои, не стремился к развалу ГДР. Я просто хотел как-то помочь людям найти выход из беспросветного и, как им казалось, безнадежного положения». В 1989 г. Эберхард Зайдель одним из первых подписал манифест «Нового форума» - оппозиционного блока, сыгравшего ключевую роль в процессе политических преобразований. «Но все получилось бы и без моего участия. Мы были только катализатором, а не наконечником стрелы». Манифест вызвал колоссальный отклик. И вот уже в квартире Зайделей сидели тридцать-сорок человек, с которыми они раньше не были знакомы, и открыто говорили о том, что надо изменить в ГДР. 

Работая в одном из комитетов общенационального круглого стола, Эберхард Зайдель принимал участие в подготовке законодательной базы для свободных выборов. Его рекомендации были, однако, отвергнуты руководством ведущих партий. Пробыв год депутатом первого свободно избранного берлинского городского совета, он испытал на себе и «попытки ограничить творческий подход к принятию решений, и нежелание коллег подвергать сомнению существующие структуры».

Сегодня Эберхард Зайдель снова работает врачом-терапевтом, продолжая заниматься деятельностью в защиту мира.